Aviacijos bazė atkūrus Lietuvos nepriklausomybę

1992 m. sausio 2 d. Krašto apsaugos ministerijoje buvo įsteigta Aviacijos tarnyba, kurios viršininku paskirtas plk.ltn. Z. Vegelevičius.

1992 m. sausio 23 d. krašto apsaugos ministro įsakymu buvo patvirtinti Aviacijos tarnybos Aviacijos bazės etatai. Tačiau Aviacijos bazė buvusiame Barysių aerodrome buvo pradėta kurti tik kovo mėnesį, kai Lietuvos Respublikos Vyriausybės potvarkiu aviakompanijos "Lietuvos avialinijos" 1992 m. balandžio 30 d. Šiaulių jungtinė aviacijos eskadrilė, 24 lėktuvai An-2, eskadrilei priklausantys pastatai ir teritorija buvo perduoti Krašto apsaugos ministerijos Aviacijos tarnybai. Ši technika ir ją aptarnaujantys žmonės sudarė Pirmosios aviacijos bazės, įsikūrusios Barysių aerodrome (Joniškio raj.), branduolį. Nuo 1993 m. kovo 1 dienos Aviacijos tarnybą reorganizavus į Lietuvos kariuomenės karines oro pajėgas ( KOP), Aviacijos bazė buvo pervadinta - KOP Pirmąja aviacijos baze.
 

Pirmasis Aviacijos bazės štabas

Barysių aerodrome

Išvedant Rusijos kariuomenę iš Lietuvos, pagrindinis KOP karių uždavinys, buvo perimti aerodromus ir juose esančią įrangą kuo geresnės būklės ir neleisti jų suniokoti. Dar tebešeimininkaujant Rusijos transporto aviacijos divizijai, 1993 m. Panevėžio raj. Pajuosčio aerodrome buvo pradėta formuoti Antroji aviacijos bazė. 1993 m. balandžio 21 d. KOP vado įsakymu Nr. 26 "Dėl Aviacijos bazių pavadinimo" Aviacijos bazė, dislokuota Pajuostyje (Panevėžio raj.), pavadinta "Lietuvos Respublikos Krašto apsaugos ministerijos Karinių oro pajėgų Antroji aviacijos bazė". Antrojoje Aviacijos bazėje buvo dislokuotos dvi eskadrilės: naikintuvų ir transporto.

Nuo 1995 m. iki 1999 m. Pirmoji aviacijos bazė buvo perdislokuota į šalia Zoknių oro uostą, kuriame Sovietinės okupacijos metais buvo dislokuoti Sovietų Sąjungos karo aviacijos naikintuvų pulkas, radioelektroninės kovos ir žvalgybinės aviacijos lėktuvų eskadrilės.  

Aviacijos bazės bendras vaizdas (Zokniai)

Vykdant Lietuvos Respublikos krašto apsaugos ministro 2000 m. kovo 24 d. įsakymą Nr. 306 "Dėl Kariuomenės pajėgų dalinių, junginių, tarnybų ir kitų karinių vienetų reorganizavimo", 2000 m. KOP Antroji aviacijos bazė buvo reorganizuota: transporto lėktuvai AN-26 bei mokomieji naikintuvai L-39 perduoti Pirmajai aviacijos bazei. Į Šiaulius išvyko ir transporto bei naikintuvų grandžių lakūnai. Tuo metu iš Šiaulių į KOP Antrąją aviacijos bazę buvo perkelti KOP Pirmosios aviacijos bazės sraigtasparniai, kartu atvyko ir sraigtasparnių įgulos. 

Vykdant Lietuvos Respublikos krašto apsaugos ministro 2004 m. rugpjūčio 18 d. įsakymą Nr. V-901 "Dėl Lietuvos kariuomenės karinių oro pajėgų karinių vienetų reorganizavimo ir steigimo" nuo 2004 m. spalio 1 dienos Karinių oro pajėgų Pirmoji ir Antroji aviacijos bazės buvos reorganizuotos į Lietuvos kariuomenės karinių oro pajėgų Aviacijos bazę.

Iki 2004 m. Aviacijos bazėje buvo dislokuojami tik reaktyviniai lengvieji atakos naikintuvai ir transporto lėktuvai, po KOP Pirmosios ir Antrosios aviacijos bazių reorganizavimo - ir sraigtasparniai.

1992 m. birželio 12 d. pirmą kartą po Lietuvos Nepriklausomybės atkūrimo iš Barysių aerodromo į orą pakilo lėktuvas An-2 su Vyčio Kryžiais - Lietuvos karo aviacijos skiriamaisiais ženklais - ant sparnų. Todėl ši diena yra laikoma Pirmosios aviacijos bazės įkūrimo diena, o šiandien ir KOP Aviacijos bazės įkūrimo diena. 

 Aviacijos bazės vadovybė 1992 - 2010 m.

1992 m. balandžio mėn. - 1992 m. liepos mėn. Pirmajai aviacijos bazei vadovavo karo lakūnas mjr. Jonas NOREIKA; 

1992 m. liepos mėn. iki 1997 m. gruodžio mėn. - karo lakūnas mjr. Jonas MARCINKUS

1997 m. gruodžio mėn. - 2000 m. liepos mėn. - karo lakūnas plk. Edvardas MAŽEIKIS (šiuo metu k. l. generolas majoras)

2000 m. liepos mėn. - 2002 m. liepos mėn. - karo lakūnas   mjr. Audronis NAVICKAS (šiuo metu suteiktas laikinas  k. l. pulkininkas ).

2002 m. liepos mėn. - 2004 lapkričio mėn. - karo lakūnas mjr. Devis MARTUSEVIČIUS (šiuo metu k. l. pulkininkas leitenantas)

2004 m. lapkričio mėn. - 2006 m. birželio mėn. - karo lakūnas plk. ltn. Artūras BALYNAS;

2006 m. birželio mėn. - 2010 m. liepos mėn. plk.ltn. Audronis NAVICKAS (šiuo metu suteiktas laikinas k. l. pulkininkas ).